搜索

基因敲除载体构建

瓦力生物基因基于自身研发的EditX™基因编辑平台,采用优化升级的CRISPR/Cas9系统,可综合研究目的、基因与细胞等情况,制定合适的敲除策略,构建符合需求的敲除载体。

服务详情

服务类型 敲除慢病毒载体/敲除腺病毒载体/敲除腺相关病毒载体/敲除瞬转载体
交付标准 1.质粒图谱
2.质粒测序结果
3.质粒扩增操作说明
4.质粒(三条sgRNA分装)
周期/价格 快至2周,1800元起   在线咨询
现在常用CRISPR-Cas9系统来实现基因敲除,CRISPR-Cas9系统具由sgRNA和Cas9两部分组成。Cas9蛋白是一种由gRNA引导的DNA切割酶,具有特异切割双链DNA的活性。在gRNA的引导下,Cas9蛋白能够识别并结合到目标DNA序列上。一旦Cas9蛋白与目标DNA序列结合,其切割活性就被启动,导致DNA双链断裂(DSB),成为细胞修复机制的一个信号。细胞对于DNA双链断裂有两种主要的修复方式:非同源末端连接(NHEJ)和同源重组(HDR)。
 
*非同源末端连接(NHEJ):在没有模板DNA的情况下,细胞顺利获得NHEJ修复机制将断裂的DNA两端连接起来。但这一过程容易引入小的插入或缺失(Indels),导致基因失活。这种修复方式常被用于基因敲除。
 
*同源重组(HDR):当提供一段模板DNA时,细胞可以顺利获得HDR修复机制在修复过程中精确插入新的DNA序列。这种修复方式被用于引入特定的突变或基因片段。
 

敲除方案

  • 移码敲除

     针对基因的编码区前端设计sgRNA,实现碱基非3的倍数的indel

  • 大片段敲除

     针对基因设计sgRNA,实现长片段删除

  • 小片段敲除

    针对基因设计sgRNA,实现短片段删除,并造成移码突变

服务优势

高活性的Cas9质粒
经过优化的高活性Cas9蛋白,使得基因敲除变得更加高效
高效的sgRNA设计
自主研发的高效sgRNA设计算法
多种敲除质粒类型
可构建不同类型的敲除载体,如瞬转敲除质粒、慢病毒敲除质粒、腺病毒敲除质粒、腺相关病毒敲除质粒等
科研设计
可根据靶细胞,优化相应的Cas9表达盒和sgRNA表达盒                                                                 

交付标准

1 质粒图谱
2 质粒测序结果
3 质粒扩增操作说明
4 质粒(三条sgRNA分装)

质粒图谱

 
lentiCRISPR慢病毒敲除质粒图谱
 
 
 
SpCas9瞬转敲除质粒图谱

Advantage and Characteristic

Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic
Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic
Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic
Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic

参考文献

α1,6-Fucosyltransferase contributes to cell migration and proliferation as well as to cancer stemness features in pancreatic carcinoma

胰腺导管腺癌(Pancreatic ductal adencarcinoma, PDAC)是一种极其恶性的肿瘤,占所有胰腺癌的90%。研究表明,癌细胞表面的异常糖基化变化与肿瘤进展和转移正相关,α1,6-岩藻糖基转移酶(FUT8)是负责催化核心岩藻糖基化的关键酶,其在多种恶性肿瘤中的表达和激活异常,与多种生理和病理过程相关,尽管FUT8在其他类型的癌症中的作用已被观察到,但其在PDAC恶性转化中的具体分子机制和作为潜在治疗靶点的可能性尚不清楚。
研究人员使用CRISPR/Cas9系统在MIA PaCa-2和PANC-1细胞中敲除FUT8基因,顺利获得Transwell迁移实验和创伤愈合实验评估FUT8-KO细胞的迁移能力,顺利获得MTT实验和集落形成实验评估FUT8-KO细胞的增殖能力,并检测了FUT8-KO细胞中癌症干细胞标志物的表达水平。结果显示,与野生型细胞相比,FUT8-KO细胞的迁移能力、增殖和集落形成能力显著降低,FUT8-KO细胞中癌症干细胞标志物的表达降低。FUT8基因敲除细胞揭示了FUT8在胰腺癌中的重要作用,证明了FUT8可能是胰腺癌治疗的一个潜在靶点,为未来的胰腺癌治疗策略提供了新的视角。

精选客户文章

IF=50.5
nature

全球超过一半的肝细胞癌(HCC)病例发生在中国,但现在针对中国人群中乙型肝炎病毒(HBV)相关HCC的全基因组分析研究非常有限。为了突破这种限制,研究人员启动了“中国肝癌图谱项目”(CLCA),旨在对中国人群中的HCC进行大规模的全基因组分析以理解其独特的发病机制和进化过程。该项目对494例HCC肿瘤样本进行了深度全基因组测序(平均测序深度为120×),并分析了匹配的对照血液样本,揭示了HBV相关HCC的详细基因组特征。研究发现,除了已知的编码区驱动基因(如TP53和CTNNB1)外,还存在6个新的编码区驱动基因(包括FGA)和31个非编码区驱动基因。此外,研究还揭示5种新的突变特征(包括SBS_H8),以及HBV整合形成细胞外环状DNA(ecDNA)的现象,这些ecDNA可导致癌基因扩增和表达增加。顺利获得功能验证实验,研究人员证实了FGA、PPP1R12B和KCNJ12等基因的突变能够显著影响HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力。这项研究结果不仅丰富了人们对HCC基因组学的理解,也为HCC的诊断和治疗提供了新的潜在靶点。

候选驱动因子概况

IF=27.4
Advanced material

肌腱损伤急性炎症期中,巨噬细胞过度激活会导致编码骨桥蛋白OPN的SPP1过表达,影响组织再生。CRISPR-Cas13由于具有RNA编辑和快速降解的能力,在组织修复方面具有巨大潜力,但缺乏合适有效的递送方法。对此,研究人员系统筛选了针对巨噬细胞的阳离子聚合物,开发了一种能够高效递送Cas13核糖核蛋白复合物(Cas13 RNP)进入巨噬细胞的纳米簇载体。顺利获得反应性氧种(ROS)响应性释放机制,该系统能够在肌腱损伤的急性炎症微环境中特异性抑制巨噬细胞中SPP1的过表达。实验结果表明,这种靶向策略显著减少了损伤诱导的SPP1产生巨噬细胞的出现,降低了成纤维细胞的激活,并减轻了肌腱周围的粘连形成。此外,该研究还揭示了SPP1顺利获得CD44/AKT信号通路促进成纤维细胞活化和迁移的机制,并顺利获得抑制这一通路有效缓解了肌腱损伤后的粘连问题。

用于PA治疗的巨噬细胞免疫微环境激活mRNA编辑策略的示意图

IF=12.8
Biomaterials

脊髓损伤(SCI)是一种导致感觉自主神经和运动功能的永久性损害的严重致残性疾病。干细胞疗法,尤其是间充质干细胞(MSCs),在SCI治疗中展现出巨大潜力但其再生能力有限,这限制了其在组织再生中的应用。研究团队观察到ABPCs衍生的EVs(EVsABPC)可能携带促进组织再生的生物活性信号,因此他们从鹿角芽基祖细胞(ABPCs)中提取并修饰了细胞外囊泡(EVsABPC),并将其应用于脊髓损伤(SCI)的治疗研究。研究人员发现EVsABPC能够显著增强神经干细胞(NSCs)的增殖,促进轴突生长,减少神经元凋亡,并顺利获得调节炎症反应将巨噬细胞从促炎的M1型极化为抗炎的M2型。此外,经过工程化改造的EVsABPC(顺利获得激活细胞穿透肽修饰)能够更有效地靶向SCI损伤部位,显著改善神经再生和运动功能恢复。这些结果表明,EVsABPC是一种极具潜力的SCI治疗候选方案。

图解摘要

IF=12.2
Journal of Hazardous Materials

S-异丙甲草胺(S-MET)是我国生产和使用量最大的除草剂之一,其化学特性导致其可在土壤中持久存在以及容易顺利获得淋溶和沉降污染地表水和地下水,最终影响植物生长和顺利获得食物链危害人类生命健康。鉴于现有检测方法的局限性和对高效分析技术的迫切需求,该研究以S-metolachlor为对象,利用哺乳动物表达系统生成相关重组抗体。在成功表达抗体的基础上,成功建立了基于这些抗体的免疫分析方法,用于监测环境水样中的S-异丙甲草胺残留。icELISA结果显示,重组抗体的灵敏度和特异性与亲本单抗相似,可保持原有的生物学活性,对于江水、农田水和自来水中的S-MET,具有良好的准确性和重复性。

图解摘要

IF=10.7
Biosensors and Bioelectronics

微小RNA(miRNA)是一类小的非编码RNA分子,顺利获得与特定靶基因的信使RNA(mRNA)相互作用来调控基因表达。miRNA在多种疾病的发生、开展过程中扮演着重要角色,被认为是极具潜力的疾病生物标志物。该研究利用CRISPR/Cas12a开发了一种为DBmRCA的新型miRNA检测技术。该技术利用无连接酶的哑铃探针和高灵敏度的CRISPR/Cas12a信号输出策略,实现了在30分钟内对miRNA的高精度定量分析。研究团队顺利获得临床样本验证了该技术的有效性,发现miR-200a和miR-126在肺癌组织中的表达水平显著降低,且该技术与传统方法结果一致。DBmRCA技术具有时间效率高、灵敏度强和操作流程简化等优点,为临床miRNA分析提供了一种可靠的工具,有望助力肺癌的早期诊断和治疗。

图解摘要

参考文献

DOI:10.1038/s41586-024-07054-3

全球超过一半的肝细胞癌(HCC)病例发生在中国,但现在针对中国人群中乙型肝炎病毒(HBV)相关HCC的全基因组分析研究非常有限。为了突破这种限制,研究人员启动了“中国肝癌图谱项目”(CLCA),旨在对中国人群中的HCC进行大规模的全基因组分析以理解其独特的发病机制和进化过程。该项目对494例HCC肿瘤样本进行了深度全基因组测序(平均测序深度为120×),并分析了匹配的对照血液样本,揭示了HBV相关HCC的详细基因组特征。研究发现,除了已知的编码区驱动基因(如TP53和CTNNB1)外,还存在6个新的编码区驱动基因(包括FGA)和31个非编码区驱动基因。此外,研究还揭示5种新的突变特征(包括SBS_H8),以及HBV整合形成细胞外环状DNA(ecDNA)的现象,这些ecDNA可导致癌基因扩增和表达增加。顺利获得功能验证实验,研究人员证实了FGA、PPP1R12B和KCNJ12等基因的突变能够显著影响HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力。这项研究结果不仅丰富了人们对HCC基因组学的理解,也为HCC的诊断和治疗提供了新的潜在靶点。

候选驱动因子概况

DOI:10.1002/adma.202311964

肌腱损伤急性炎症期中,巨噬细胞过度激活会导致编码骨桥蛋白OPN的SPP1过表达,影响组织再生。CRISPR-Cas13由于具有RNA编辑和快速降解的能力,在组织修复方面具有巨大潜力,但缺乏合适有效的递送方法。对此,研究人员系统筛选了针对巨噬细胞的阳离子聚合物,开发了一种能够高效递送Cas13核糖核蛋白复合物(Cas13 RNP)进入巨噬细胞的纳米簇载体。顺利获得反应性氧种(ROS)响应性释放机制,该系统能够在肌腱损伤的急性炎症微环境中特异性抑制巨噬细胞中SPP1的过表达。实验结果表明,这种靶向策略显著减少了损伤诱导的SPP1产生巨噬细胞的出现,降低了成纤维细胞的激活,并减轻了肌腱周围的粘连形成。此外,该研究还揭示了SPP1顺利获得CD44/AKT信号通路促进成纤维细胞活化和迁移的机制,并顺利获得抑制这一通路有效缓解了肌腱损伤后的粘连问题。

用于PA治疗的巨噬细胞免疫微环境激活mRNA编辑策略的示意图

DOI:10.1016/j.biomaterials.2022.121990

脊髓损伤(SCI)是一种导致感觉自主神经和运动功能的永久性损害的严重致残性疾病。干细胞疗法,尤其是间充质干细胞(MSCs),在SCI治疗中展现出巨大潜力但其再生能力有限,这限制了其在组织再生中的应用。研究团队观察到ABPCs衍生的EVs(EVsABPC)可能携带促进组织再生的生物活性信号,因此他们从鹿角芽基祖细胞(ABPCs)中提取并修饰了细胞外囊泡(EVsABPC),并将其应用于脊髓损伤(SCI)的治疗研究。研究人员发现EVsABPC能够显著增强神经干细胞(NSCs)的增殖,促进轴突生长,减少神经元凋亡,并顺利获得调节炎症反应将巨噬细胞从促炎的M1型极化为抗炎的M2型。此外,经过工程化改造的EVsABPC(顺利获得激活细胞穿透肽修饰)能够更有效地靶向SCI损伤部位,显著改善神经再生和运动功能恢复。这些结果表明,EVsABPC是一种极具潜力的SCI治疗候选方案。

图解摘要

DOI:10.1016/j.jhazmat.2021.126305

S-异丙甲草胺(S-MET)是我国生产和使用量最大的除草剂之一,其化学特性导致其可在土壤中持久存在以及容易顺利获得淋溶和沉降污染地表水和地下水,最终影响植物生长和顺利获得食物链危害人类生命健康。鉴于现有检测方法的局限性和对高效分析技术的迫切需求,该研究以S-metolachlor为对象,利用哺乳动物表达系统生成相关重组抗体。在成功表达抗体的基础上,成功建立了基于这些抗体的免疫分析方法,用于监测环境水样中的S-异丙甲草胺残留。icELISA结果显示,重组抗体的灵敏度和特异性与亲本单抗相似,可保持原有的生物学活性,对于江水、农田水和自来水中的S-MET,具有良好的准确性和重复性。

图解摘要

DOI:10.1016/j.bios.2024.116676

微小RNA(miRNA)是一类小的非编码RNA分子,顺利获得与特定靶基因的信使RNA(mRNA)相互作用来调控基因表达。miRNA在多种疾病的发生、开展过程中扮演着重要角色,被认为是极具潜力的疾病生物标志物。该研究利用CRISPR/Cas12a开发了一种为DBmRCA的新型miRNA检测技术。该技术利用无连接酶的哑铃探针和高灵敏度的CRISPR/Cas12a信号输出策略,实现了在30分钟内对miRNA的高精度定量分析。研究团队顺利获得临床样本验证了该技术的有效性,发现miR-200a和miR-126在肺癌组织中的表达水平显著降低,且该技术与传统方法结果一致。DBmRCA技术具有时间效率高、灵敏度强和操作流程简化等优点,为临床miRNA分析提供了一种可靠的工具,有望助力肺癌的早期诊断和治疗。

图解摘要

FAQ

如何选择合适的载体类型?
选择载体时,应考虑实验的目的和宿主细胞的类型。例如,质粒载体常用于细菌中基因的表达或扩增,病毒载体则更适合用于哺乳动物细胞中的基因转导。除此之外,载体的启动子、复制子以及抗生素选择标记也需要根据具体需求进行选择。
载体在进行扩增时,通常会使用大肠杆菌(E. coli)菌株来进行。在实验操作中,常用的大肠杆菌菌株是DH5α。DH5α适用于大多数非重组型载体。对于重组型载体,如慢病毒载体和转座子载体等,可以使用Stbl3菌株进行扩增。Stbl3是一种特殊的大肠杆菌(E. coli)菌株,来源于,HB101 E. coli strain,其基因组含有重组酶recA13突变,这可以有效地抑制长片段末端重复区的重组,从而降低错误重组的概率。

联系我们

*
*
*
选择国家
*
来源:
联系我们
*
*
*
*
来源:
service online

  • 留言
  • You can send email to contact us.
    邮箱
  • You can send email to contact us.
    电话
    联系电话
    中国总部
    18102225074(微信同号)
  • This is Edgene's wechat.
    微信
    瓦力生物企业微信二维码

  •  回到顶部